Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RNP2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0U1RNP2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0U1RNP2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0U1RNP2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms