Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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