Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trbv30A0A0B4J1P1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trbv30A0A0B4J1P1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trbv30A0A0B4J1P1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv30A0A0B4J1P1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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