Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5538W4VSP6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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