Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms