Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer1Q9Z2Y3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms