Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms