Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms