Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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