Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms