Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn8Q9Z260 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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