Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms