Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms