Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms