Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VarsQ9Z1Q9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms