Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms