Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms