Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rspo1Q9Z132 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.9 ms