Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms