Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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