Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gipc1Q9Z0G0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms