Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms