Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms