Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn5Q9WVD4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms