Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stxbp4Q9WV89 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms