Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx9Q9WUH2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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