Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lemd3Q9WU40 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd3Q9WU40 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms