Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek3Q9R0A5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms