Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmfrQ9R049 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms