Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms