Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms