Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trpc3Q9QZC1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trpc3Q9QZC1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trpc3Q9QZC1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trpc3Q9QZC1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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