Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms