Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Exo1Q9QZ11 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Exo1Q9QZ11 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Exo1Q9QZ11 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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