Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms