Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VapbQ9QY76 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VapbQ9QY76 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VapbQ9QY76 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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