Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Kcnip3Q9QXT8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Kcnip3Q9QXT8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcnip3Q9QXT8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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