Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Limd1Q9QXD8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Limd1Q9QXD8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Limd1Q9QXD8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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