Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms