Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms