Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms