Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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