Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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