Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms