Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms