Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms