Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms