Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms