Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms