Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem1Q9JKE2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms